网箱养殖如何破坏近海细菌网络，深入探究其对环境的影响
网箱养殖改变了近海区域细菌群落的共生网络和功能
微生物在维持海洋生态系统的健康和稳定方面发挥着根本性的作用，既是环境变化的媒介，也是环境变化的指标。水产养殖已成为全球粮食供应的基石，提供重要的蛋白质来源，网箱养殖是近海海鲜养殖的重要方式，对海洋微生物环境有着深远的影响。一项新的研究揭示了这些水产养殖系统对周围水域细菌群落的连锁影响。
研究人员利用高通量测序对东北近海网箱扇贝养殖场不同水层的细菌群落进行了分析，这种方法使他们能够识别和比较不同水层中的细菌群落。
研究发现，网箱周围水域的细菌丰富度有所增加，这一发现表明水产养殖活动引入或支持了多样化的细菌种群。网箱周围不同水层的细菌群落差异很大，在不同的水层（网箱上方、平行和下方）观察到不同的细菌群落组成，蓝藻在网箱上方繁盛，而拟杆菌门和厚壁菌门分别在网箱平行处和网箱下方占主导地位。笼子上方以光养为主，笼子下方以化学异养为主，氮呼吸为主，这表明它们对微环境具有特殊的适应性。网络分析表明，网箱内的细菌群落复杂但不稳定，可能是由于环境条件波动造成的，网箱养殖直接影响环境变量和细菌丰富度，进一步引起细菌群落组成及其生态功能的变化。
这些发现强调了水产养殖对海洋生态系统的细微影响。通过改变细菌群落，水产养殖可以对营养循环、水质和整体生态系统健康产生连锁效应。这项研究强调了可持续水产养殖实践的必要性，以最大限度地减少生态破坏。
参考文献：Xiaoyan Guan 1,Zelong Zhao 1,Jingwei Jiang,Yongjia Pan,Shan Gao,Bai Wang,Zhong Chen,Xuda Wang,Hongjuan Sun,Bing Jiang,Ying Dong,Zunchun Zhou，Net cage aquaculture alters the co-occurrence network and functions of bacterial communities in offshore areas. Marine Environmental Research Volume 204, February 2025, 106872，doi.org/10.1016/j.marenvres.2024.106872
网箱养殖及其附近非水产养殖环境中微生物群落差异
Zetian Liu等人利用宏基因组学研究了网箱养殖对微生物多样性和功能潜力的影响，比较了三个石斑鱼养殖网箱与附近三个非养殖区地表水体的理化指标和微生物多样性。采用高通量宏基因组测序分析采集样本中的微生物群落，利用生物信息学工具识别和分类微生物物种，评估其多样性，并分析其功能基因，研究对微生物种群与环境因素进行了相关性分析，以了解水产养殖活动对微生物群落的影响。同时，研究测量溶解氧、溶解无机氮、可溶性活性磷和NH₄⁺等物理化学指标，以与微生物数据相关联。
研究发现，与非水产养殖区相比，水产养殖环境中的富营养化指标显著增加，水产养殖环境中弧菌和假交替单胞菌的数量显著增加。与碳、氮、硫代谢相关的微生物功能基因受到水产养殖活动的显著影响。大多数微生物类群与溶解无机氮、可溶性活性磷和NH₄⁺呈正相关，与溶解氧呈负相关。
该研究阐明了水产养殖引起的水体富营养化对浮游细菌群落多样性和功能的重大影响。这些发现强调了网箱养殖对微生物群落及其功能的重要影响，强调了可持续水产养殖实践的必要性，以尽量减少对环境的影响。
参考文献：Comparative metagenomic analysis of microbial community compositions and functions in cage aquaculture and its nearby non-aquaculture environments. May 2024 Frontiers in Microbiology 15(1398005)，DOI:10.3389/fmicb.2024.1398005
高通量测序如何揭示水产养殖引起的细菌多样性变化？
高通量测序 (HTS) 是一种强大的工具，可用于分析各种环境中的微生物群落，包括受水产养殖影响的微生物群落。这种方法可以全面识别和量化水产养殖系统中的细菌种类，从而深入了解细菌多样性如何因水产养殖实践而发生变化。
HTS 可以对水、沉积物和其他环境样本中的微生物 DNA 进行测序。这使研究人员能够检测各种细菌，包括稀有或以前未检测到的物种。在水产养殖系统中，细菌多样性的变化通常是由于营养丰富、有机物沉积和抗生素使用等因素造成的。
研究表明，水产养殖系统（例如鱼类或贝类养殖场）会改变微生物群落，通常会导致在营养丰富的环境中茁壮成长的细菌数量增加。HTS 揭示了这些丰度变化，识别了与农业活动相关的关键细菌类群 。
HTS 还提供可用于构建共现网络的数据，揭示不同细菌物种如何相互作用。这些网络有助于了解水产养殖如何影响微生物关系，有时会导致特定物种占主导地位或平衡生态系统的破坏 。
通过在不同时间点取样，HTS 可以检测细菌种群的时间变化，从而了解水产养殖实践如何随时间影响微生物群落。
思考
长期暴露于网箱养殖环境如何影响微生物群落的稳定性和功能？
关键微生物物种在维持水产养殖环境中微生物群落平衡方面发挥什么作用？
水温、盐度和营养水平等环境因素如何与水产养殖活动相互作用从而影响微生物群落动态？
这些有趣的问题旨在激发你的思考，助你更深入地理解，希望能为你带来新的启示和帮助~~~
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